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MIDRC, la basse de données COVID des sociétés savantes américaines

14/08/2020
De Bruno Benque avec RSNA

En créant le Medical Imaging Ressource and Data Center (MIDRC), les sociétés savantes américaines s’associent pour créer des outils pour la détection, le diagnostic et le pronostic de COVID-19. Plus de vingt laboratoires universitaires sont impliqués dans le projet.

L'American College of Radiology® (ACR®), la Radiological Society of North America (RSNA), ainsi que l’American Association of Physicists in Medicine (AAPM) se sont associés pour développer ensemble le nouveau Medical Imaging Ressource and Data Center (MIDRC), une base de données open source contenant des images médicales de dizaines de milliers de patients atteints de coronavirus (COVID-19).

Entraîner des algorithmes d’IA pour aider les radiologues à mieux hiérarchiser les images radiologiques COVID-19

Cette plateforme bénéficie en outre du soutien financier du National Institute of Biomedical Imaging and Bioengineering (NIBIB) des National Institutes of Health (NIH) par le biais d'un contrat avec le Pr Maryellen Giger, de l'Université de Chicago, qui accueillera le MIDRC. Les activités du MIDRC sont codirigés par les trois associations d'imagerie médicale. Sont ainsi impliqués les Drs Etta Pisano et Michael Tilkin (ACR®), les Drs Curtis Langlotz, et Adam Flanders (RSNA) et les Prs Maryellen Giger et Paul Kinahan (AAPM).

« La base de données MIDRC fournira un outil essentiel pour aider la communauté radiologique, les médecins et les scientifiques à mieux comprendre le COVID-19 et ses effets biologiques sur les humains, précise le Dr Etta Pisano, directrice de la recherche à l'ACR. Ces connaissances et les progrès technologiques que le registre peut engendrer aideront en fin de compte les acteurs du soin à sauver des vies ». De nombreuses questions restent en effet sans réponse sur la manière dont l'imagerie pourrait être déployée contre COVID-19. Par exemple, les algorithmes d'intelligence artificielle (IA) pourraient aider les radiologues à mieux hiérarchiser et analyser les scanners thoraciques. Mais des milliers d'images doivent être collectées et annotées pour entraîner ces algorithmes. Le MIDRC réunira des ingénieurs, des médecins et des scientifiques pour collecter et organiser les données afin de répondre à ces questions cruciales.

Produire de nouveaux outils pour la détection, le diagnostic et le pronostic de COVID

« La RSNA est heureuse de collaborer à cette ressource vitale pour la recherche sur le COVID-19, poursuit le Pr Curtis Langlotz, de l'Université de Stanford, chargé de liaison avec le conseil d'administration de la RSNA pour la technologie de l'information. Cette équipe dédiée de chercheurs, d'ingénieurs et de professionnels de l'imagerie produira de nouveaux outils pour la détection, le diagnostic et le pronostic du COVID-19 en agrégeant d'énormes quantités d'images et d'autres données cliniques provenant de patients COVID-19. Nous attendons avec impatience l'établissement de liens avec d'autres référentiels de données nationaux pour permettre une analyse complète de la maladie COVID-19 et de ses manifestations radiologiques. »

Financé dans le cadre du processus spécial d'urgence COVID-19 des National Institutes of Health, le MIDRC créera une plate-forme en libre accès pour collecter, annoter, stocker et partager des images médicales liées au COVID-19. Le MIDRC tirera bientôt parti des efforts de collecte de données existantes pour télécharger plus de 10 000 radiographies thoraciques et images de tomodensitométrie pulmonaire COVID-19, dont beaucoup provenant du registre de recherche d'imagerie ACR COVID-19 et de la base de données de ouverte RSNA International COVID-19 (RICORD). Cela permettra aux chercheurs du monde entier d'accéder à une multitude d'images et de données cliniques pour répondre aux questions cliniques et logistiques du COVID-19.

Vingt laboratoires universitaires impliqués pour trouver des solutions et fournir des pipelines d’IA pour les autres maladies

« L'accès à cette ressource sans précédent alimentera bientôt la recherche accélérée en IA pour fournir un meilleur diagnostic, de nouveaux traitements et une surveillance plus efficace pour se prémunir contre la résurgence du COVID-19, remarque le Pr Maryellen Giger. Il s'agit d'une étape importante dans l'effort contre le COVID-19. » Le MIDRC travaillera sur cinq projets de développement d’infrastructures et supervisera douze projets de recherche, impliquant environ 20 laboratoires universitaires, pour trouver des solutions à la pandémie de COVID-19. Le MIDRC travaillera en outre à étendre les services pour fournir des données d'imagerie et des pipelines d'IA pour aider à lutter contre d'autres maladies.

« Le COVID-19 est notre cible immédiate, mais le MIDRC permettra à terme aux communautés médicales et scientifiques de mobiliser des images et des données pour lutter contre d'autres maladies existantes et les futures menaces sanitaires», conclut le Pr Paul Kinahan, de l'Université de Washington et président du comité de recherche de l'AAPM.

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